Yamano Mitsuha est une jeune fille de 18 ans qui est souvent comparée à une collégienne en raison de sa petite taille. À l’approche des épreuves d’entrée à l’université, elle perd son frère et ses parents. En raison du choc de la perte de sa famille, elle rate tous ses examens.
Un jour Mitsuha tombe d’une falaise et se retrouve dans un autre monde similaire à l’Europe Médiévale. Suite à un combat mortel contre des loups, elle découvre qu’il est possible de passer de ce monde au sien. Mitsuha décide de vivre en habitant dans les 2 mondes à la fois, gagner de l’argent dans le monde médiéval et vivre confortablement dans son monde moderne.
Tout en gardant secret l’existence d’un autre monde, Yamano Mitsuha va se procurer des armes afin d’explorer l’autre monde… Mais en raison de sa taille, les habitants la prennent pour une petite fille.
